Основы биоинформатики и сборки генома: от исходных данных до анализа

Современные биологические исследования в значительной степени опираются на геномные данные, но анализ необработанных файлов секвенирования может показаться невероятно сложным для начинающих. Этот курс проведет вас через основные этапы биоинформатической обработки данных, показывая, как превратить необработаны последовательности в значимые сборки генома непосредственно на стандартном компьютере. Вы начнете с ключевой терминологии, изучения основных концепций секвенирования следующего поколения, метрики качества и форматов файлов. Через четкие письменные объяснения и вычислительные примеры вы будете продвигаться шаг за шагом от сбора данных до реконструкции генома. Что вы узнаете: • Понимание ключевых форматов геномных данных и фундаментальной терминологии секвенирования • Получение публичных наборов данных секвенировки из открытых биологических хранилищ • Оценка качества чтения и применение стратегий обрезки для очистки необработанных данные • Выполнение сборки генома de novo с использованием стандартных биоинформатических инструментов • Оценить метрики сборки и оценить В книге представлены основные принципы и методы геномного анализа, а также методы, которые используются в настоящее время. Книга предназначена для биологов, студентов и энтузиастов, не имеющих предыдущего опыта в области биоинформатики. Начните читать и развивать свои навыки генома анализа сегодня.