Основы программирования и биоинформатики сборки генома

Современная биология генерирует огромное количество данных, которые требуют сложных вычислительных средств для интерпретации. Этот курс познакомит вас с миром биоинформатики, сосредоточив внимание на сборке генома - процессе соединения миллионов фрагментов ДНК в одну последовательность. Вы перейдете от понимания биологических основ к реализации алгоритмов, которые помогают ученым идентифицировать неизвестные патогены и изучать генетический код. Прочитав подробные объяснения и применив логику к сценариям программирования, вы создадите прочный фундамент в том, как программное обеспечение управляет биологическими открытиями. Что вы узнаете: * Понять основные биологические и вычислительные принципы сборки генома * Применять понятия теории графов, такие как пути Де Бруйна, к реконструкции последовательностей * Практика k-мер анализа для эффективной обработки фрагментированных генетических данных * Внедрение фундаментальных алгоритмов перекрывающегося расположения и консенсуса для картирования ДНК * Изучить современные модели программирования для биоинформатики, включая тип-безопасные структуры данных * Анализ логики решения реальных загадок бактериальных вспышек с помощью кода Курс начинается с основной терминологии и истории секвенирования, а затем переходит к алгоритмическим задачам, используемым современными исследователями. Эта текстовая программа предназначена для начинающих, имеющих базовый интерес к программированию и биологии; предыдущий опыт в области биоинформатики не требуется. Начните свое путешествие в пересечение кода и наук о жизни сегодня.