Метагеномы окружающей среды и анализ микробиома для начинающих

Микроскопические организмы управляют основными химическими циклами нашей планеты, но для их изучения необходимо смотреть не только на отдельные виды, но и на целые микробные сообщества. Понимание того, как расшифровать эти сложные микробиомы окружающей среды, является ключом к современной биотехнологии, экологии и науке об окружающих условиях. Этот текстовый курс предоставляет четкий путь к пониманию того, как взаимодействуют микробные популяции и как мы изучаем их с помощью современных геномных инструментов. Сосредоточившись на концептуальном понимании и письменных упражнениях, вы построите прочную основу в науке о микробиоме и экологической метагеномике. Вы перейдете от понимания основ микробной экологии к концептуализации того, как данные высокопроизводительного секвенирования обрабатываются, анализируются и интерпретируются для решения экологических проблем. Что вы узнаете: - Понять основные принципы микробной экологии и как микробиомы функционируют в различных средах. - Изучить различия между секвенированием маркеров, метагеномикой и метатранскриптомикой. - Изучить концептуальные шаги современных биоинформатических конвейеров для обработки считываемых последовательностей. - Анализ влияния микробных сообществ на глобальные биогеохимические циклы и состояние окружающей среды. - интерпретировать функциональные метагеномные данные для выявления метаболических путей в экосистеме. - Оценка применения экологической метагеномики в реальном мире в области биовосстановления и сохранения окружающей среды. Путешествие начинается с фундаментальных биологических определений и концепций микробной экологии, прежде чем перейти к технологиям секвенирования, рабочим процессам обработки данных и практическим тематическим исследованиям окружающей среды. Вы укрепите свои знания с помощью письменных упражнений по анализу и концептуальных сценариев устранения неполадок. Этот курс предназначен для начинающих биоинформатиков, ученых-экологов и любопытных учащихся, не имеющих предыдущего опыта в области метагеномики. Начните свое путешествие в невидимый мир микробов окружающей среды сегодня.